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一般要经过浸泡、刷洗、酸洗、清洗四个步骤。
1、浸泡：新的或用过的玻璃器皿应先用清水浸泡，以软化、溶解附着物。新玻璃器皿使用前只需用自来水刷洗，然后用5%盐酸浸泡过夜即可；用过的玻璃器皿往往含有大量的蛋白质和油脂，干燥后很难刷掉。因此，使用后应浸入清水中刷洗。
2、刷洗：将浸泡过的玻璃器皿放入洗涤剂水中，用软毛刷反复刷洗。不留死角，防止损坏器皿表面光滑度。将清洗干净的玻璃器皿清洗并风干以进行酸洗。
3、酸洗：酸洗是指将前述器皿浸泡在清洗液，又称酸液中，通过酸液的强氧化作用，去除器物表面潜在的残留物质。酸洗时间不应少于六小时，通常过夜或更长时间。放置和拿取器具时要小心。
4、冲洗：刷洗、酸洗后，器皿必须用水彻底冲洗。酸洗后器皿是否清洗干净，直接影响细胞培养的成败。腌制器具要手洗。每个容器应反复“注水-倒空”至少15次，之后用重蒸馏水浸泡2-3次。干燥或包装前晾干备用。
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